Дефолтные феникс/овер ид мультисела определяют по названию хмлки, т.е. банально Integer.parseInt(fileName).
Если хочется как угодно назвать, то надо пихать ид к примеру в ноду config в файле и считывать оттуда.
Ну или формировать к примеру названия хмлок как "id name.xml", и перед парсингом имени на тему ид отрезать от этого имени все что идет после первого же пробела. К примеру у меня именно так сделано.